Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLD1Q13393 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms