Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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