Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms