Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK18Q07002 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms