Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms