Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms