Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SMN2-214ENST00000626847 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 OR4K1-202ENST00000641172 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC073911.1-201ENST00000592296 504 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC007346.1-202ENST00000602826 684 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms