Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MPP1Q00013 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms