Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms