Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms