Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXW4P57775 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXW4P57775 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FBXW4P57775 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXW4P57775 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXW4P57775 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXW4P57775 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXW4P57775 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXW4P57775 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FBXW4P57775 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FBXW4P57775 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FBXW4P57775 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms