Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERFP50548 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERFP50548 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms