Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms