Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms