Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCND2P30279 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCND2P30279 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCND2P30279 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCND2P30279 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCND2P30279 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms