Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YY1P25490 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
YY1P25490 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
YY1P25490 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YY1P25490 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YY1P25490 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YY1P25490 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms