Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ME2P23368 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ME2P23368 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ME2P23368 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ME2P23368 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ME2P23368 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ME2P23368 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ME2P23368 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms