Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDHBP21953 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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