Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMNB1P20700 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252 ms