Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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