Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms