Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms