Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

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Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATE1O95260 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATE1O95260 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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