Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms