Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms