Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL33A6NCF5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms