Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HHLA3Q9XRX5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms