Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMG5Q9UPR3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms