Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP25Q9UHP3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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