Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms