Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BPIFA1Q9NP55 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPIFA1Q9NP55 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms