Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms