Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCTN6-201ENST00000221114 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB6-201ENST00000350021 666 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590408.1-201ENST00000430905 453 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02474-202ENST00000441160 1148 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN20-222ENST00000509774 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CTHRC1-203ENST00000520337 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATF2-207ENST00000409833 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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