Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms