Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms