Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2AFJQ9BTM1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms