Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTKNQ9BST9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms