Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GPA33Q99795 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms