Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms