Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNDC1Q96C34 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms