Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms