Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms