Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC12Q8WUD4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms