Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms