Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms