Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP13-4Q3LI77 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms