Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PROX2Q3B8N5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms