Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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RRN3P1Q2M238 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RRN3P1Q2M238 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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