Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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