Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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